El compuesto principal en el aceite de eucalipto es eucaliptol o 1,8-cineol. Puede constituir desde el 30% hasta el 90% del aceite. Otros compuestos notables en el aceite incluyen alfa-pineno, limoneno, alfa-felandreno, aromadendreno, beta-pineno, canfeno, epiglobulol, pinocarvona, piperitona y terpineol. Muchos de estos compuestos, como el eucaliptol, alfa-pineno, limoneno, etc., tienen propiedades antibacterianas comprobadas.
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El aceite de eucalipto es rico en cineol, un antiséptico que mata a las bacterias que pueden causar mal aliento.