¿Puedo usar dióxido de carbono liberado de hielo seco para hacer una guantera anaeróbica para transferir bacterias de un recipiente a otro?

Sospecho que estarás bien. El único problema potencial que vería es que el CO2 tiende a mezclarse con el agua, formando ácido carbónico. Dependiendo de las bacterias específicas, la inundación con CO2 puede ser perjudicial, pero no debe tener ninguna exposición directa al oxígeno.

La otra preocupación sobre el CO2 (que puede ser una de las razones del estándar oficial) es que es más peligroso que algo así como el nitrógeno. El nitrógeno es un gas inerte y te asfixiará si los niveles son demasiado altos, pero no es directamente dañino. El CO2, por otro lado, puede ser más directamente dañino, si se acumulan altas concentraciones a su alrededor. Si usa CO2, debe asegurarse de estar familiarizado con los peligros, los protocolos de manejo y las advertencias. El área deberá estar bien ventilada con monitores en su lugar para asegurarse de que no se ponga en riesgo.

No veo por qué no, el hielo seco debe mantener un charco de dióxido de carbono en el fondo de su espacio de trabajo, deje que se acumule durante un tiempo para eliminar el aire y trate de no removerlo demasiado. Maneje el hielo seco con guantes ya que puede causar quemaduras.
Por lo general, el nitrógeno seco o el dióxido de carbono de una botella se utilizan para esta tarea, es posible que desee realizar algunas pruebas preliminares para optimizar la cantidad de hielo seco y obtener mejores resultados.