La apnea del sueño y el VIH casi no tienen nada que ver el uno con el otro. La apnea obstructiva del sueño suele ser un defecto estructural, también hay algunas variedades neurológicas.
El VIH afecta el sistema inmune. Tener VIH no causa ni previene la apnea. Algunas infecciones de seguimiento podrían agravar las apneas existentes.