¿Cuál es la proporción de AT y GC en el ADN de las bacterias?

El contenido bacteriano de G + C varía según la especie en una amplia gama (aproximadamente 30G + C a 75% G + C) con E.coli justo en el medio.

Bacillus es un género muy conocido con G + C en torno al 35%. Los micoplasmas son otro gran GC extremadamente bajo. Streptomyces y Thermus serían ejemplos en el extremo superior.

Una utilidad de esto es que si secuencia una población mixta, como en un experimento de metagenomixs, el contenido de G + C se puede utilizar para dividir las lecturas en contenedores, simplificando el cálculo.

Los cambios locales en el contenido medio de G + C también pueden sugerir una transferencia horizontal reciente.

Una revisión que explora las posibles fuerzas selectivas para el contenido de G + C El contenido de GC de genomas bacterianos

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Las actinobacterias se caracterizan como “bacterias con alto contenido de GC”. En Streptomyces coelicolor A3 (2), el contenido de GC es del 72%. El contenido de GC de la levadura (Saccharomyces cerevisiae) es del 38% y el de otro organismo modelo común, el berza ( Arabidopsis thaliana), es 36%. Debido a la naturaleza del código genético, es prácticamente imposible que un organismo tenga un genoma con un contenido de GC que se acerque al 0% o al 100%. Una especie con un contenido extremadamente bajo de GC es Plasmodium falciparum (GC% = ~ 20%), y generalmente es común referirse a tales ejemplos como ricos en AT en lugar de pobres en GC.

La regla de Chargafs establece que las proporciones de AT y CG son más o menos iguales y esto se ha confirmado en gran medida, pero la investigación en los últimos 70 años. Algunos organismos tendrán un poco más de CG o AT (51-55%) pero no hay

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