Los dos reinos de bacterias son Eubacteria y Archaebacteria. Aunque ambos son procariotas, ambos son diferentes en muchos aspectos, como
Las arqueobacterias viven en ambientes hostiles como aguas termales, agua salada y mar profundo, etc. Las eubacterias viven en el mismo ambiente que es familiar para los humanos. Las cianobacterias o las algas verdes azules son ejemplos de eubacterias. Eubacteria causa enfermedades humanas.
Eubacteria contiene peptidoglicano pero las arquebacterias contienen pseudomureína.
