Por lo general, solo pregunto a las personas que lo hacen. Cada proteína es diferente y viene con su propio conjunto de desafíos, ¡así que múltiples puntos de vista ayudan!
Pero un buen recurso (aunque un poco anticuado) que realmente rompe el proceso de principio a fin es:
Clonación, expresión génica y purificación de proteínas
Si terminas necesitando expresar la proteína en células de insectos o mamíferos, este libro es un buen comienzo:
Producción de proteínas recombinantes: nuevos sistemas de expresión microbianos y eucarióticos
Creo que los libros están a la venta desde Amazon.