Las bacterias facultativas pueden crecer con o sin oxígeno. La mayoría de las bacterias gastrointestinales utilizan esto; cuando están en la fase anaeróbica (menos del 1% de O2) se metabolizan, crecen y se reproducen sin oxígeno, aunque lentamente. Cuando crecen en presencia de oxígeno (20%) crecen y se replican más rápido.
El mejor ejemplo son las enterobacteriáceas.
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