Creo que está buscando una respuesta simple, no una respuesta de tesis complicada para ir a un doctorado.
La clorofila es el término utilizado para los pigmentos que se encuentran en los cloroplastos de las plantas y las algas y los pigmentos verdes que se encuentran en las cianobacterias. La base básica de la molécula es la misma C55H72O5N4Mg (se parece a la molécula de hemo de la sangre, por cierto, en su estructura y vía de formación). Los diferentes tipos de cianobacterias agregan un grupo funcional diferente.
Los orgánulos que producen la clorofila son diferentes: cloroplastos para las plantas, la membrana celular para las bacterias. Si la membrana celular se pliega, se llama tilacoide.