¿Cuáles son las ventajas y desventajas de la mutagénesis UV para crear diversidad en una población bacteriana?

Gran pregunta! La mutagénesis UV, cuando se usa en una buena configuración experimental, puede ser una técnica muy poderosa. Para hacer una buena selección o selección genética, debe tener una forma fácil de seleccionar / seleccionar para el (los) fenotipo (s) de interés: crecimiento en un medio particular, expresión de una construcción de gen informador, etc. Una vez que haya configurado su pantalla / condiciones de selección, ¡estás listo para elegir tu mutágeno!

Ventajas de usar mutagénesis UV:

  • es fácil y no requiere entrenamiento especializado
  • es muy barato: la mayoría de los laboratorios tienen algún tipo de fuente de luz ultravioleta ya tirada, por lo que no es necesario comprar ningún equipo o reactivo adicional
  • es relativamente seguro para el / los investigador / es utilizarlo – trabajar con mutágenos químicos puede ser más arriesgado, ya que muchos de ellos son muy desagradables – pero la lámpara UV generalmente se encuentra en una caja cerrada, sin peligro de exposición al investigador .

(Desventaja:

  • genera mutaciones de forma relativamente aleatoria y puede terminar generando más de una mutación en un genoma. Si tiene un buen sistema genético (incluida la capacidad de mover su (s) mutación (es) de interés a un fondo limpio, o recrearlas con bastante facilidad, esto no es un problema.) Sin embargo, esta mutagénesis aleatoria puede ser una ventaja en algunos casos en los que busca genes novedosos que participan en un proceso, por ejemplo.

Desventajas:

  • Dado que la luz UV va a ser tóxica en algún nivel, es necesario determinar una curva de muerte UV y encontrar las condiciones óptimas para la mutagénesis: un poco de desfallecimiento y un paso adicional antes de poder recolectar alegremente tus mutantes favoritos y continuar con tus experimentos.
  • cada mutágeno, incluida la luz ultravioleta, tendrá su propio espectro particular de mutaciones que induce; algunas son mejores para provocar mutaciones de transición o transversión, por ejemplo. En algunos casos, una pantalla de mutagénesis UV simplemente no produce ningún mutante del fenotipo deseado, mientras que otro mutágeno podría funcionar perfectamente y dar el resultado deseado.

La radiación ultravioleta no solo causa mutaciones en el ADN, sino que también causa un daño grave a la cadena de ADN que incluso podría dar lugar a que cualquier mutación que ocurra no pueda ser replicada. (En mi opinión personal, no existen ventajas en tales mutaciones a menos que esté estudiando el efecto de la radiación ultravioleta sobre el crecimiento de células cancerosas de la piel).

Hay mejores formas de mutar el ADN de una población bacteriana que tiene un menor riesgo de daño en el ADN. Por ejemplo, el ADN bacteriano muta naturalmente cuando está bajo estrés por un químico o péptido antibacteriano. La ventaja de este método es que las mutaciones que encontrarás son biológicamente relevantes para el funcionamiento de las células bacterianas que se estudian.