¿Dos bacterias / virus que se han dividido en células de la misma bacteria / virus comparten 100% de ADN?

Este es generalmente el caso. El ADN genómico es el mismo a menos que haya mutaciones. Sin embargo, me gustaría señalar que las bacterias también pueden contener ADN plásmido. Los plásmidos no siempre se segregan adecuadamente durante la replicación. Entonces, una célula hija puede retener un plásmido mientras que la otra no, porque una copia del plásmido no se transporta a través de la célula antes de la división. Si hay varios plásmidos, diferentes células a veces pueden obtener diferentes combinaciones de plásmidos. Además, los plásmidos generalmente se replican usando un mecanismo diferente al del genoma, por lo que pueden producir más o menos copias de sí mismos por unidad de tiempo. Esto podría causar diferencias entre las células hijas también. (Si una celda recibió solo dos copias y la otra recibe siete, por ejemplo).
Además, la transferencia horizontal de genes puede conducir a la introducción de nuevo ADN en las bacterias. Esto puede venir en forma de nuevos plásmidos o ADN que se integra en el genoma bacteriano.
También es posible que desee buscar mutantes de ramificación cromosómicas. No sé mucho sobre eso, pero podría ser interesante.

Cuando una célula bacteriana se divide o un virus se replica, el resultado es idéntico al original, salvo cualquier mutación / error

Voy a dar un paso en esto para señalar que las bacterias y los virus en realidad no se reproducen de la misma manera. Las bacterias se replican a través de la división celular, y excluyendo plásmidos y mutaciones de la discusión, las dos bacterias resultantes de una única división de bacteria son esencialmente idénticas. No sé si la epigenómica se produce en las bacterias en este momento, por lo que es posible que, debido a factores ambientales, el área del epigenoma de la bacteria pueda tener varianza, y en ese caso, técnicamente la respuesta sería “no”.

Los virus no se reproducen por división celular de esa manera. Infecta una célula hospedadora de vida saludable y luego secuestra el aparato de reproducción de la célula para fabricar más virus. Dadas las mismas advertencias que se dieron para las bacterias, en esa medida las respuestas seguirían el mismo camino hacia sí o no.