Antes que nada, dependerá mucho del tipo de organismo, además del propósito, el equipo disponible y los fondos disponibles.
En el laboratorio, probablemente comenzaría con las siguientes alternativas
A. ¿Debo hacer una PCR rápida o qPCR en mi bacteria?
Hierva las bacterias, a menudo con un detergente suave como Triton-x100 y un tampón para mantener el pH en aproximadamente 8. Este artículo tiene un ejemplo de esto: https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc…
B. ¿Necesito tener ADN bacteriano más purificado para ejecutar mi PCR o qPCR?
Purificar con el método de fenol cloroformo. Ejemplo aquí: http://www.bio-protocol.org/wzpd…
¿Por qué las cianobacterias son principalmente acuáticas?
¿Puedo esterilizar mi cadena de plata colocándola en una sartén con agua hirviendo?
¿Qué bacteria produce carbonato de calcio?
¿Cuál es la similitud entre bacterias y hongos?
¿Por qué no enviamos bacterias a Marte para que puedan poblar el planeta y producir oxígeno allí?
C. ¿Necesito ADN altamente purificado para la secuenciación o algo así?
Use un kit disponible comercialmente que se sabe que funciona para sus bacterias. Existen varios kits y personalmente he usado este kit: kit FastDNA ™ SPIN para extracción de ADN de suelo (116560200)
De nuevo, estas son solo alternativas, y los protocolos tendrían que ser modificados dependiendo de su bacteria y propósito.
