Las especies bacterianas implicadas en la digestión (descomposición) de materiales orgánicos complejos en aguas residuales líquidas y semilíquidas son en su mayoría anaeróbicas y algunas anaeróbicas facultativas.
Generalmente no se agregan como cultivos puros o culturas mixtas. La mayoría de las veces están presentes en el entorno de procesamiento y se vuelven predominantes a través de los parámetros de procesamiento.
Las bacterias estrictamente aeróbicas rara vez están involucradas.
Puedo ubicar brevemente un ejemplo específico que se usa en el sistema de acuaponia para cultivar peces y vegetales. Es un sistema cerrado y de reciclaje. Hay muchas variaciones diferentes, la que estoy describiendo es la siguiente.
Los peces se crían en un tanque de agua con una bomba de agua para hacer circular el agua. Los peces se suministran con alimentación. La proteína es utilizada por los peces y se libera principalmente como urea en el agua. El agua se bombea a la plataforma elevada en la que crecen las plantas. La urea se convierte en amoníaco por un grupo de bacterias, presente de forma natural en el lecho de la planta; luego otro grupo de bacterias convierte el amoníaco en nitrito / nitrato. Las plantas usan el nitrato como fuente de nitrógeno para el crecimiento. El agua libre de urea fluye por gravedad a través de un filtro para eliminar todos los materiales sólidos y el agua bastante limpia ingresa (por gravedad) en el tanque.
Entonces, aquí el agua con aguas residuales del pescado es limpiada por bacterias anaerobias / anaeróbicas facultativas para suministrar agua limpia al tanque de peces.