Cómo detectar si una nueva bacteria o virus está en un ambiente

Como señaló Edward Tyler, las matrices de anticuerpos solo se pueden usar para detectar bacterias y virus que ya se han aislado. Los métodos de secuenciación de ADN se usan con mayor frecuencia para buscar nuevos organismos, pero este enfoque también tiene sus puntos ciegos. Un virus o bacteria que contiene ácidos nucleicos modificados químicamente no puede ser copiado por las enzimas polimerasas usadas para amplificarlos a niveles detectables. Un organismo verdaderamente nuevo con una química fundamentalmente diferente de su material genético sería completamente olvidado.

Este es un problema importante para quienes buscan formas de vida extraterrestres, como en las distintas sondas de Marte. Su enfoque, en general, ha sido buscar evidencia de transformaciones químicas que es poco probable que ocurran espontáneamente en el entorno local, pero en cambio sean consistentes con la química de la extracción y el crecimiento de la energía, las características de la vida.

Para ser honesto, creo que esto es mucho más difícil de lo que parece.

Tendrá que usar una secuencia de microarrays que represente una proteína de superficie de la nueva bacteria / virus, que por supuesto requeriría una muestra de esa bacteria / virus, y sueros que contienen anticuerpos que son al menos reactivos cruzados con el antígeno de superficie.

Probablemente sería mejor secuenciar todo el ADN en una muestra que creas que está contaminada con este organismo / virus, y buscar una secuencia que sea nueva, aunque es probable que haya genes altamente conservados representados.

Honestamente, nunca intenté detectar algo de lo que todavía no tenía la secuencia genómica completa.