¿Podrían los humanos eventualmente dividirse en dos subpoblaciones de día y noche, considerando que porciones de la sociedad ya se pasan la noche despiertas y durmiendo?

Es teóricamente posible. Pero es muy poco probable ya que los trabajos día / noche no se heredan de una generación a otra. Entonces la mezcla ocurre regularmente. Necesitarías una división mucho más fuerte para muchas generaciones.