Hola Logan,
Como estoy seguro que sabes, hay una gran variedad de diferentes sistemas de transposones que se han utilizado con éxito en diferentes especies bacterianas … la mayoría de los que se usan para la mutagénesis se utilizan porque “saltan” de una manera relativamente no específica en el genoma, para que pueda obtener una buena cobertura en cualquier tipo de pantalla de mutagénesis / selección que está tratando de hacer.
Muchos de los factores que determinan la elección del sistema de transposones tienen que ver con 1) qué antibióticos se pueden usar en una especie bacteriana específica (a qué no son resistentes), y 2) método de administración que se puede usar (fago , conjugación, electroporación) …
Un sistema que ha sido utilizado de forma relativamente amplia (no puedo pensar en lo último de mi cabeza si se lo ha usado en Burkholderia cepacia o no), es posible que lo descubras con una búsqueda rápida en PubMed o conociendo las características generales de tu especie como se describió anteriormente – es el sistema EZ-Tn5, vendido por Epicentre – Introducción a EZ-Tn5- Transposomas- y Transposómica In Vivo-
EZ-Tn5 ha encontrado una aplicación bastante amplia porque puede electroporarse directamente en su bacteria de interés, y porque (a diferencia de otros vectores que codifican transposón / transposasa juntos, o transposona transposón / lisiada), implica en realidad electroporar en el complejo ADN: proteína del transposón: transposasa, por lo que debería (en teoría) obtener solo un “salto” estable y único del transposón en el genoma objetivo.
Las variantes más comunes son los casetes de resistencia a kanamicina o trimetoprim en el transposón Tn5, pero es posible que pueda construir otras variantes; todo depende de los antibióticos que pueda usar en su cepa y de cómo esté configurando su pantalla / selección de interés.
