¿Los pomos de las puertas, los teléfonos celulares, etc. están tan llenos de gérmenes como se los considera, ya que generalmente no están hechos de material orgánico para ayudar a las bacterias a prosperar?

Sí. Porque cada vez que los tocas, dejas material orgánico en su superficie.
Las células muertas de la piel, el sudor con sales y proteínas y, por supuesto, las bacterias muertas y muertas de sus manos están manchadas en los pomos, teléfonos, teclados y demás.