Existen estrategias comunes que los virus de ADN emplean para replicar sus genomas. Ya sea que describa estas estrategias como “idénticas” o “diferentes” depende del nivel de resolución de cada estrategia.
Presentaré categorías amplias aquí, pero obviamente, hay subcategorías dentro de estos en niveles de detalle más finos.
Usando la polimerasa del huésped para replicar el genoma viral
Los pequeños virus de ADN (polioma, papiloma) obligan a la maquinaria de replicación del huésped a replicar sus genomas. Para hacer esto, estos virus generalmente adoptan orígenes de replicación que pueden reconocerse fácilmente por el genoma del huésped. Para garantizar la replicación, también fuerzan (y mantienen) a la célula en un estado celular (fase S) durante el cual el ADN del huésped se replica activamente, asegurando así que las enzimas de replicación del huésped se expresarán. La mayor variabilidad en este sistema (en mi opinión) son las múltiples formas en que cada virus obliga a las células anfitrionas a entrar en la fase S.
Usando la polimerasa viral para replicar el genoma viral
Los virus de ADN Mid-Large (Adeno, Herpes, Pox, Caudovirales Phage) generalmente codificarán su propia maquinaria de replicación en su genoma. Debido a esto, muchas de las reglas de replicación clásicas que unen genomas eucariotas / bacterianos no son válidas para estos genomas. Como cada virus codifica una maquinaria de replicación o polimerasa viral diferente, existe una gran variabilidad en la forma en que estos sistemas regulan su propia replicación.
En cuanto a los límites de espacio de secuencia, eso es lo que nadie puede adivinar en este momento. El espacio de secuencia de los virus no se ha muestreado lo suficiente como para poder determinar si hay secuencias que son incompatibles con la replicación.
