Históricamente, la primera fue la observación de que los antibióticos matan o paralizan las mitocondrias. Fue particularmente evidente en el caso de los inhibidores de la síntesis proteica bacteriana tales como la lincomicina. Tales observaciones son anteriores al descubrimiento de la estructura del ADN por al menos 10 años, pero fueron lo suficientemente sugestivas como para que la gente comenzara a hacer preguntas sobre los orígenes de las mitocondrias.
Motivó trabajos como este: http://www.pnas.org/content/70/1… (Steinman & Hill, homologías de secuencias entre superóxido dismotásico bacteriano y mitocondrial). Eso fue antes de que la secuenciación del ADN se convirtiera en una cosa, por lo que tuvieron que hacer una secuenciación directa de proteínas para establecer la homología (ya estaba claro que la secuencia determina la estructura).
Con las modernas técnicas de secuenciación que generan información masiva sobre una gran variedad de mitocondrias y bacterias, estas investigaciones se han vuelto casi triviales. En realidad, es muy difícil identificar las características en las mitocondrias que son únicas para ellos. Lo que es bastante peculiar acerca de las mitocondrias es la organización de alto nivel y el grado de su integración con el huésped, pero las partes de las que están hechas son claramente bacterianas.
Incluso las más sofisticadas: la antigua homología del sitio de contacto mitocondrial y el sistema organizador de crestas apuntan a un origen endosimbiótico de las crestas mitocondriales.
