Los movimientos agudos e irregulares de los ojos durante el sueño REM se relacionan con el contenido del sueño. Todo el cuerpo se movería bastante durante el sueño REM si no hubiera un mecanismo para suprimir los músculos esqueléticos durante esta fase de sueño. Si esta supresión se daña (lo cual ocurre muy raramente de forma natural, pero se ha inducido con suficiente frecuencia en animales de prueba), la persona actuará según los sueños. Esto es lo que sucede con los ojos.
Debido a que los ojos son controlados por el cerebro en una materia diferente y más directa que los músculos de nuestras extremidades, no se ven afectados por la supresión del tono muscular, de manera similar que las personas severamente paralizadas también pueden mover los ojos incluso si no puede mover el resto de su cuerpo
En cuanto a los detalles sobre la diferencia entre los dos mecanismos de control, recomiendo la respuesta de Paul King: la respuesta de Paul King a ¿Por qué los ojos no están paralizados durante el sueño REM?
Consideré fusionar las preguntas, pero eso dejaría fuera la pregunta de por qué los movimientos oculares durante REM son tan notablemente diferentes del sueño no REM. Es a causa de los sueños vívidos, o bien el sueño y el movimiento tienen una causa común, porque están muy sincronizados.
