Respuesta corta: sí
Respuesta larga: la resonancia magnética tiene el mejor contraste de tejidos blandos, razón por la cual es la modalidad de preferencia especialmente en estudios neurológicos. Recuerdo que un cirujano principal me dijo una vez durante mis días académicos, que el cerebro es uno de los tejidos más suaves de nuestro cuerpo. Estoy hablando desde la perspectiva de la ingeniería (ser ingeniero), tampoco sé mucho sobre las migrañas, pero no creo que otras modalidades como la TC o la PET puedan capturar mejor el problema anatómico que la RM.
Pero si se debe a alguna anormalidad funcional en el cerebro, entonces puede ser PET o SPECT puede dar más información.