Será extremadamente difícil detectar la presencia de microorganismos en el agua sin el auxilio del perfil microscópico y bioquímico de la muestra de agua. A pesar de todo, los criterios primarios básicos para la detección de microbios en aguas claras dependen invariablemente del estudio óptico y olfativo del agua. Para mayor confirmación, MPN, IMViC y SPC son las pruebas estándar para verificar la pureza del agua.
Sin embargo, también dependería de:
1) el tipo de bacteria presente en ella, por ejemplo, los productores de pigmentos impartirán decoloración. Se ha informado que los microbios esporulados producen formaciones similares al algodón en la base de los tubos de ensayo (en este caso, el vidrio).
2) la concentración de células bacterianas. Se observa turbidez visible cuando la concentración celular es de aproximadamente 10 ^ 8.
3) se sabe que las bacterias producen olor característico, por lo tanto, cualquier olor significativo puede ser indicativo de contaminación microbiana.
4) las bacterias filamentosas producen grupos visibles que se pueden visualizar.