Supongo que con el “conjunto de fase de sueño” te refieres a un ciclo de sueño.
Técnicamente, el sueño REM tiene lugar al final de un ciclo, ya que normalmente el sueño comienza con NREM (no REM) 1, 2 y 3, seguido de REM, lo que nos hace categorizarlo como la última etapa de un ciclo.
Sin embargo, es relativo ya que la fase completa del sueño puede percibirse como una alternancia continua y más o menos regular de las etapas del sueño, por lo que es difícil decir si estaba comenzando un nuevo ciclo o terminando uno.
En ese sentido, es incorrecto pensar en una fase de sueño como un conjunto de ciclos, y la segunda como conjuntos de etapas, aunque es un concepto útil para comprender y discutir la arquitectura del sueño.